Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GDE1Q9NZC3 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GDE1Q9NZC3 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GDE1Q9NZC3 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GDE1Q9NZC3 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GDE1Q9NZC3 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GDE1Q9NZC3 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
GDE1Q9NZC3 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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GDE1Q9NZC3 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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GDE1Q9NZC3 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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