Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC47Q96A33 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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