Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms