Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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PEX6Q13608 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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PEX6Q13608 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
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PEX6Q13608 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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PEX6Q13608 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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PEX6Q13608 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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