Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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