Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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