Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms