Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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