Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms