Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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HOXD10P28358 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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HOXD10P28358 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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