Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP35Q9P2H5 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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