Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms