Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
LAMA3Q16787 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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