Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms