Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms