Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms