Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms