Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms