Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms