Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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PTPREP23469 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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PTPREP23469 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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PTPREP23469 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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PTPREP23469 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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PTPREP23469 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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PTPREP23469 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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PTPREP23469 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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PTPREP23469 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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PTPREP23469 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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PTPREP23469 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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PTPREP23469 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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PTPREP23469 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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