Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AGRNO00468 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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