Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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BRPF3Q9ULD4 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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BRPF3Q9ULD4 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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BRPF3Q9ULD4 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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BRPF3Q9ULD4 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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BRPF3Q9ULD4 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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