Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SALL3Q9BXA9 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SALL3Q9BXA9 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms