Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIKE1Q9BRV8 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms