Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.59□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM3DQ96BQ1 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms