Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms