Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms