Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms