Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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