Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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BPTFQ12830 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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BPTFQ12830 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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BPTFQ12830 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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