Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
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NEDD8Q15843 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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NEDD8Q15843 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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NEDD8Q15843 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
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NEDD8Q15843 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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NEDD8Q15843 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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NEDD8Q15843 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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NEDD8Q15843 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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NEDD8Q15843 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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NEDD8Q15843 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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NEDD8Q15843 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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NEDD8Q15843 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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