Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.5 ms