Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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