Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms