Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms