Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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COL4A6Q14031 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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COL4A6Q14031 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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COL4A6Q14031 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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COL4A6Q14031 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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COL4A6Q14031 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL4A6Q14031 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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