Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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