Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms