Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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CBX3Q13185 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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CBX3Q13185 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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CBX3Q13185 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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CBX3Q13185 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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CBX3Q13185 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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CBX3Q13185 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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CBX3Q13185 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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