Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRTM2O43300 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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