Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CRXO43186 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms