Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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CHCHD4Q8N4Q1 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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CHCHD4Q8N4Q1 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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CHCHD4Q8N4Q1 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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CHCHD4Q8N4Q1 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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CHCHD4Q8N4Q1 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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CHCHD4Q8N4Q1 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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