Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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RTN1Q16799 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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RTN1Q16799 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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