Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms