Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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