Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
USF2Q15853 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USF2Q15853 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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