Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms