Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1AQ15573 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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