Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms