Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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